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Descifrando rutas metabólicas de la degradación de colorantes azoicos en Shewanella xiamenensis LC6 mediante análisis transcriptómico y proteómico para su aplicación en procesos de biorremediación
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SARS-CoV-2 es un virus ARN monocatenario positivo envuelto que forma viriones de entre 50-200 nm de diámetro [1]. El genoma del virus codifica cuatro proteínas estructurales: la proteína S (SPIKE), la proteína E (envoltura), la proteína M (membrana) y la proteína N (nucleocápsido) [2]. La proteína N se encuentra dentro del virión asociada con el ARN viral, mientras que las otras tres están asociadas con la envoltura viral. La proteína S se ensambla en homotrímeros y formando las estructuras que sobresalen de la envoltura. SPIKE contiene el dominio de unión al receptor de la célula huésped (RBD) y, por ende, es la proteína que determina el tropismo del virus. También es responsable de la fusión virión-membrana celular, permitiendo la liberación del genoma viral al interior de la célula huésped [3,4]. SARS-CoV-2 penetra las células del huésped utilizando una exopeptidasa de membrana como receptor (ACE2: Enzima convertidora de angiotensina 2), presente principalmente en tejidos renales, pulmonares y cardíacos [5]. El role fisiológico de ACE2 es transformar la angiotensina I en angiotensina 1-9 y la angiotensina II en angiotensina 1-7. ACE2 está asociado a la protección contra la hipertensión, la arteriosclerosis y otros procesos vasculares y pulmonares. En modelos animales, la ausencia de ACE2 conduce a un incremento del daño pulmonar e induce un síndrome de dificultad respiratoria aguda. Por otro lado, la sobreexpresión de ACE2 protege al pulmón [6¿8]. Se han observado niveles altos de angiotensina II en pacientes con COVID-19 y también una correlación entre la carga viral y el daño pulmonar. Este desequilibrio del sistema renina-angiotensina-aldosterona podría estar relacionado con la inhibición de ACE2 [9]. Este efecto ya ha sido descrito en el brote de SARS-CoV-1 [10,11]. Basándose en la estructura del complejo SPIKE-ACE2 [12], investigadores del MIT desarrollaron un péptido (SBP1) que se une fuertemente a la proteína S, inhibiendo su interacción c
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En este proyecto nos proponemos funcionalizar quitosano con el péptidos que interactúan con la proteína SPIKE del virus SARS-CoV-2. Este polímero encapsularía al virión, neutralizándolo por interacción con toda su circunferencia y así impidiendo su internalización celular.
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Neutralización de SARS-CoV-2 por derivados de quitosano funcionalizados proyecto a cargo de Dr. Juan Manuel Lopez
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ESTUDIO DE LOS FACTORES DE VIRULENCIA IMPLICADOS EN LA TRANSMIGRACIÓN DE TRIPANOSOMA CRUZI
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En este proyecto se desarrollará una metodología novedosa y más eficiente para la determinación del grado de acetilación del biopolímero quitosana mediante resonancia magnética nuclear de 1H y que permitirá, además, evaluar la secuencia de las unidades repetitivas en la cadena del polímero.
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En el mundo solo existen 3 técnicas capaces de determinar con resolución atómica la estructura de una molécula. Estas son la cristalografía de rayos X (RX), la microscopia electrónica criogénica (MEC) y la Resonancia Magnética Nuclear (RMN). El Perú solo cuenta con una de ellas, el equipo de RMN Bruker Avance III HD 500 MHz disponible en la PUCP. La importancia de determinar la estructura de una biomolécula es la de entender su mecanismo de acción, su rol biológico; información vital, por ejemplo, en el diseño de fármacos para tratar enfermedades, entre otros. El instrumento de RMN con el que se contaba antes de este proyecto solo le permitía la determinación de estructuras moleculares de bajo peso molecular. Por consecuencia, los estudios de biología estructural (proteínas, ADN, polisacáridos) en el país, antes de este proyecto, eran inexistentes. Con este proyecto, financiado por el Programa Nacional de Innovación para la Competitividad y Productividad - Innóvate Perú, dicho instrumento ha sido equipado con una criosonda triple inversa, enfriada por Helio (liq), componente que aumentó la sensibilidad a tal nivel que estudios en un espectro amplio, tanto en el área de la Ciencias de la Salud (ensamblajes moleculares como proteínas, oligonucleótidos, sobrenadantes de bacterias), como en el de las Ciencias de los Alimentos (metabolomica, RMN cuantitativa, y otros), son ahora posibles en la PUCP. Contrato N° 203-INNOVATEPERU-EC-2016
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