Cada una de las temporadas bi anuales del PATL se han planificado con objetivos específicos, desarrollándose en Pueblo Viejo los últimos periodos.

En 1999 entramos en el quinto periodo, y se tuvo como uno de los objetivos generales del PATL preparar y realizar el proyecto de excavaciones y de puesta en valor del sitio Pueblo Viejo.

Durante las temporadas 1999/2000 y 2000/2001 en Pueblo Viejo – Pucara se ha demostrado que este extenso sitio con más 10 hectáreas de construcciones, el segundo o tercero en tamaño en el valle bajo (Pampa de las Flores), tuvo una ocupación permanente en el Periodo Horizonte Tardío. A su vez, hemos logrado definir el patrón arquitectónico del espacio doméstico y la cronología relativa del sitio.

Para los años 2001/2002 y 2002/2003 hemos previsto realizar un amplio programa de investigaciones de arquitectura en Pueblo Viejo-Pucara con el fin de precisar las funciones de espacios abiertos y techados, así como definir las reglas subyacentes en la organización espacial del sitio, y como en el diseño de formas arquitectónicas. En particular, hemos enfocado el problema de relaciones entre el estatus, el rango social y la organización espacial de las viviendas.

Para los años 2003/2004 y 2004/2005 planificamos culminar las excavaciones en la parte monumental de Pueblo Viejo-Pucara (Sector II). Se iniciaron asimismo los estudios de abastecimiento de agua así como las características de andenería y captadores de neblina en el cerros de Lomas de Pucara y Manzano. También se ha desarollado el programa de trabajos de consolidación y preparación del sitio para las visitas: eventual construcción de la sala de exposiciones en 2004/2005.

En los años 2005-2006 y 2006-2007 pensabamos seguir tres líneas paralelas de actividades en el PATL, una de ellas consiste en:
- Puesta en valor de Pueblo Viejo – Pucara acompañada de excavaciones limitadas para resolver problemas de investigación aún pendientes; excavaciones y sondeos en otros sitios arqueológicos de la quebreda de Pueblo Viejo.