La Pontificia Universidad Católica del Perú complementa su oferta académica con 29 centros e institutos especializados en el estudio de distintas disciplinas, tales como lenguas extranjeras, medio ambiente, automatización industrial y derechos humanos.
Centro de Análisis y Resolución de Conflictos (Consensos) 
Equipo interdisciplinario de la Pontificia Universidad Católica del Perú que trabaja en la prevención y tratamiento de conflictos dentro la sociedad, realizando labores de análisis y gestión, arbitraje, conciliación, capacitación y proyección social.
Centro Cultural de la PUCP (CCPUCP) Centro de extensión de la Pontificia Universidad Católica del Perú creado en 1994 con el objetivo de promover y difundir –en un moderno edificio ubicado en San Isidro– diferentes expresiones culturales, como el cine, el teatro y las artes plásticas.
Centro de Consultoría y Servicios Integrados (Innovapucp) Organización que canaliza la oferta tecnológica de la Pontificia Universidad Católica del Perú, desarrollando significativamente el valor de sus servicios no académicos y fortaleciendo la relación entre la Universidad y los sectores productivos del país.
Centro de Educación Continua (CEC) Unidad organizadora de actividades de capacitación, actualización, especialización y perfeccionamiento en diversas áreas del conocimiento, de acuerdo a las demandas del mercado y las necesidades de los estudiantes, profesionales y público en general.
Centro de Estudios, Investigación y Difusión de la Música Latinoamericana (CEMDLAT) Centro promotor del conocimiento, difusión y valoración de la música latinoamericana, fundado en 1994, que desarrolla líneas de trabajo a partir de un enfoque articulado de alto nivel que considera elementos tanto académicos como artísticos.
Centro de Estudios Filosóficos (CEF) Centro promotor de la investigación y el debate sobre cuestiones filosóficas en los diferentes campos del conocimiento, la realidad social y la cultura, que coordina y potencia las líneas de trabajo de los profesores de Filosofía en la Universidad.
Centro de Estudios Orientales (CEO) Centro difusor de la literatura, el folclor, las religiones y demás aspectos de las culturas de Oriente –tales como la japonesa, la china, la coreana y la india– mediante cursos, publicaciones y diferentes actividades realizadas dentro del campus.
Centro de Innovación y Desarrollo Emprendedor (CIDE) Unidad de la Pontificia Universidad Católica del Perú dedicada a la promoción de la cultura emprendedora dentro y fuera de la comunidad universitaria, que se desarrolla sobre la base de la formación y los conocimientos generados en la Universidad.
Centro de Investigación de la Arquitectura y la Ciudad (CIAC) Centro de investigación dirigido a comprender mejor la complejidad de la producción arquitectónica y urbanística, y alentar propuestas sólidas de ciudades y arquitectura de calidad que contribuyan a un desarrollo territorial integral y sostenible.
Centro de Investigación en Geografía Aplicada (CIGA) Centro que difunde una metodología nueva en geografía (enfoque sistémico), genera una mayor y más exacta información y conocimiento del espacio nacional, y pone en valor la investigación geográfica para el desarrollo regional y local de nuestro país.
Centro de Investigaciones y Servicios Educativos (CISE) Centro difusor de líneas de investigación en Educación y de proyectos de desarrollo educativo. También organiza los servicios de extensión universitaria y de actualización y capacitación pedagógica de la Pontificia Universidad Católica del Perú.
Centro de Investigaciones Sociológicas, Económicas, Políticas y Antropológicas (CISEPA) Centro dedicado a promover la investigación científica básica y la investigación aplicada para hacer aportes –desde un enfoque interdisciplinario– al diseño de proyectos de desarrollo que respondan de manera innovadora a los problemas sociales del país.
Centro de Música y Danzas (CEMDUC) Elenco artístico de música y danzas peruanas en el que participan los miembros de la comunidad universitaria, en un despliegue de creatividad y disciplina, que permite experimentar sentimientos y emociones que afirman una identidad personal y colectiva.
Centro de Negocios (CENTRUM) El Centro de Negocios de la Pontificia Universidad Católica del Perú es un espacio de fusión y participación de las capacidades entre lo académico y la gestión empresarial, con el objetivo central de promover el desarrollo económico de nuestro país.
Centro Preuniversitario (CEPREPUC) El Centro Preuniversitario de la Pontificia Universidad Católica del Perú prepara a sus estudiantes para superar con éxito las pruebas de ingreso a esta casa de estudios y les da las herramientas que les permitan seguir con éxito una carrera profesional.
Centro de Tecnologías Avanzadas de Manufactura (CETAM) Unidad de carácter multidisciplinario en la que se trabaja sobre la automatización industrial, haciendo posible la integración de diferentes funciones de una empresa, con la participación de ingenieros electrónicos, industriales, informáticos y mecánicos.
Instituto Confucio Instituto que tiene como finalidad ayudar a los que quieran aprender el chino mandarín y conocer la cultura china para una mejor competitividad en su carrera personal y en el mundo de acelerada globalización de hoy.
Instituto de Corrosión y Protección (ICP) Instituto creado por la Pontificia Universidad Católica del Perú, con la colaboración del gobierno alemán, para promover un mejor conocimiento de las características de la corrosión y de la tecnología a aplicarse para su control en nuestro país.
Instituto de Democracia y Derechos Humanos (Idehpucp) Instituto orientado a fortalecer el Estado de Derecho, la ciudadanía, la plena vigencia de los derechos humanos y las instituciones democráticas en el país, mediante actividades de formación académica y de promoción de espacios de diálogo y debate.
Instituto de Estudios Ambientales (IDEA) Instituto creado para formar personas con conocimientos técnicos en temas ambientales, capaces de gestionar proyectos de desarrollo sostenible que aprovechen racionalmente los recursos que ofrece la sociodiversidad y biodiversidad del Perú.
Instituto de Estudios Internacionales (IDEI) Instituto dedicado a la investigación interdisciplinaria en temas internacionales para contribuir a una mejor inserción del Perú en el escenario global, mediante actividades de difusión y promoción académica, investigación, consultoría y arbitraje.
Instituto de Etnomusicología (IDE) Instituto dedicado a preservar y revitalizar herencias culturales de las poblaciones indígenas y mestizas de los países andinos (Perú, Ecuador y Bolivia), a través del estudio y la documentación audiovisual, contextualizada, de sus expresiones musicales.
Instituto de Idiomas Católica Nueva unidad de Idiomas de la Pontificia Universidad Católica del Perú que integra la experiencia de más de 40 años de los centros e institutos que la precedieron y que está dedicada a la enseñanza del idioma inglés como lengua extranjera, y del español como segunda lengua.
Instituto de Informática (InfoPUC) El Instituto de Informática de la Pontificia Universidad Católica del Perú es una unidad de capacitación orientada a formar especialistas en diversas áreas de la Informática, preparados para incorporar en su trabajo los últimos avances tecnológicos.
Instituto de Opinión Pública (IOP) Instituto adscrito a la Facultad de Ciencias Sociales, que desarrolla investigaciones acerca de los fenómenos de opinión pública en el Perú, desde una perspectiva académica y ética, preocupada por la consolidación de la democracia.
Instituto de Radioastronomía (INRAS-PUCP) Primer instituto en el Perú dedicado a la investigación en las áreas de radioastronomía, astrofísica y ciencia e ingeniería espacial. Crea su infraestructura propia para la observación del universo y abre un nuevo camino en la búsqueda de conocimientos.
Instituto para la Calidad Instituto difusor y promotor de una cultura de la calidad en los diversos sectores de la sociedad, a través de la educación, la investigación aplicada, la consultoría y la auditoría, con los valores de excelencia y ética profesional de la Universidad.
Instituto Riva-Agüero (IRA) Escuela de altos estudios humanísticos ubicado en el centro de Lima, cuyos miembros trabajan y difunden temas de Arqueología, Arte y Cultura Popular, Derecho, Filosofía, Historia, Lengua y Literatura, con el fin de contribuir a una comprensión integral del Perú.
Teatro de la Universidad Católica (TUC) Espacio en el que se forman profesionales en Actuación y se realizan actividades para difundir el teatro, a través de la investigación, las publicaciones, y la puesta en escena de obras de repertorio universal y producciones propias.
